Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM21P19474 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM21P19474 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms