Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPI1P17947 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPI1P17947 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms