Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms