Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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DEFA4P12838 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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