Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6A1P12074 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms