Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI2P10070 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI2P10070 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI2P10070 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI2P10070 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI2P10070 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI2P10070 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI2P10070 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI2P10070 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI2P10070 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI2P10070 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI2P10070 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI2P10070 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI2P10070 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI2P10070 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI2P10070 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI2P10070 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI2P10070 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI2P10070 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI2P10070 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI2P10070 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI2P10070 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI2P10070 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI2P10070 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI2P10070 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI2P10070 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI2P10070 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI2P10070 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI2P10070 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI2P10070 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI2P10070 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI2P10070 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI2P10070 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI2P10070 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI2P10070 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI2P10070 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI2P10070 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI2P10070 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI2P10070 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI2P10070 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms