Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms