Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms