Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP10P09238 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MMP10P09238 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP10P09238 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP10P09238 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms