Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPM2P07951 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPM2P07951 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPM2P07951 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPM2P07951 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPM2P07951 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPM2P07951 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms