Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP19O94966 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP19O94966 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP19O94966 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms