Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF6O75683 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF6O75683 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF6O75683 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF6O75683 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF6O75683 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF6O75683 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF6O75683 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF6O75683 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF6O75683 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF6O75683 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF6O75683 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF6O75683 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF6O75683 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF6O75683 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF6O75683 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms