Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms