Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms