Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSNA1O43805 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms