Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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