Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms