Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms