Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MUSKO15146 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUSKO15146 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUSKO15146 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUSKO15146 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms