Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EIF3FO00303 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EIF3FO00303 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms