Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms