Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms