Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms