Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6BA6NDN3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6BA6NDN3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6BA6NDN3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6BA6NDN3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6BA6NDN3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GOLGA6BA6NDN3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms