Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms