Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms