Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms