Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MED16Q9Y2X0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms