Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC2Q9Y2U9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms