Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms