Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms