Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNMA8BQ9ULN7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms