Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP21Q9UK80 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms