Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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