Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms