Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5BQ9UGL1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms