Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms