Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COMMD3Q9UBI1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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