Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms