Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms