Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1BQ9NZR2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms