Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms