Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EMILIN3Q9NT22 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EMILIN3Q9NT22 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms