Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf88Q9H8K7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf88Q9H8K7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms