Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NYXQ9GZU5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms