Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms