Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms