Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM8Q9BZR9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms