Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms