Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPOQ9BU64 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms